Kivettynyt puu ei ole varsinaisesti kivettymä, siis kiveksi muuttunut puu. Oikea nimi tälle ilmiölle on puun kvartsinen pseudomorfoosi. Hyvin säilyneitä kivettymiä syntyy ainoastaan, kun puut kuolemansa jälkeen nopeasti peittyvät hienorakeisiin sedimentteihin, Siten puun ulkoinen rakenne säilyy ympäröivässä kivessä negatiivisena muotona. Huokosvesi kuljettaa orgaanisen aineksen pois ja korvaa sen mineraaliaineksella. Puu ei siis muutu kiveksi, vaan sen muodostaman ontelon sisältö vaihtuu. Tämä tapahtuu osittain niin hitaasti, että jopa puun sisäiset rakennepiirteet, kuten vuosirenkaat, solujen rakenne ja jopa madonreiät toistuvat. Kovuus 6,5-7.
Tunnetuin esiintymä on Holbrookissa Arizonassa sijaitseva &rdquo kivettynyt metsä&rdquo . Siellä on araukaaria-sukuun kuuluvien havupuiden jäänteitä, joista eräät ovat jopa 65m pitkiä ja 3 m paksuja. Noin 200 miljoonaa vuotta sitten ne ajautuivat nykyisille sijoilleen jokien mukana ja peittyivät muutamien satojen metrien paksuisten sedimenttien alle. Ajan mittaan kivettyneet puut sitten paljastuivat ympäröivien hiekkakivien kuluessa pois. Tämä kivettynyt puu on ikivanhaa puuta Madagaskarilta.